生物显微镜是一种用来调查生物切片、生物细胞、细菌以及活体组织培养、流质沉淀等也能够调查其他通明或者半通明物体以及粉末、细小颗粒等物体的精细光学仪器。
生物显微镜用来供医疗卫生单位、高等院校、研究院所用于微生物、细胞、细菌、组织培养、悬浮体、沉淀物等的调查，可接连调查细胞、细菌等在培养液中繁衍割裂的进程等。
在细胞学、寄生虫学、肿瘤学、免yi学、遗传工程学、工业微生物学、植物学等领域中使用广泛。其光学技术参数包括：数值孔径、分辨率、扩大率、焦深、视场宽度、掩盖差、工作距离等。这些参数并不都是越高越好，它们之间既彼此联络又彼此限制的，实践使用中应当在确保分辨率的基础上依据镜检的目的和实践情况来协调参数间的联系。
依照定位等级分类。能够分为学生级、实验级、研究级
生物显微镜。依照目镜的个数分类。能够分为单目型、双目型、三目型生物显微镜。依照目镜个数分类依照目镜个数分类按目镜和移动台的相对方位分类。能够分为正置生物显微镜和倒置生物显微镜。
正置（常规）生物显微镜的物镜在移动台的上方，倒置生物显微镜的物镜在移动台的下方。按成像原理分类。能够分为光学生物显微镜和电子生物显微镜。
光学显微镜主要由目镜、物镜、载物台和反光镜（集光镜）组成。
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